Databricks Python Data Sources

Introduced in Spark 4.x, Python Data Source API allows you to create PySpark Data Sources leveraging long standing python libraries for handling unique file types or specialized interfaces with spark read, readStream, write and writeStream APIs. | Data Source Name | Purpose | | --- | --- | | zipdcm | Read DICOM files from Zip file archives |

Documentation

Refer to the python-data-sources documentation for detailed information on how to use supplied python data sources, its features, and configuration options.

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© 2025 Databricks, Inc. All rights reserved. The source in this project is provided subject to the Databricks License [https://databricks.com/db-license-source]. All included or referenced third party libraries are subject to the licenses set forth below.

| Package | Purpose | License | Source | |---------|---------|---------|--------| | pydicom | Python api for DICOM files | MIT | https://github.com/pydicom/pydicom |

Read Zipped DICOM files saving time and storage¶

WIth the custom "zipdcm" Python Data Source, we can read zipped (and non Zipped) up DICOM files directly to extract their metadata.

Requirements:

Recommend DBR 17.0 (Apache Spark 4.0) compute
Shared cluster compute compatible
Working on serverless compute fix.
Requires pydicom==3.0.1

%pip install --quiet pydicom==3.0.1
%restart_python

Note: you may need to restart the kernel using %restart_python or dbutils.library.restartPython() to use updated packages.

%sh ls -lh ./resources/dcms

total 57M
-rwxrwxrwx 1 root root  12K Aug  1 21:09 1.3.199.1.2.3712432.1.402.1107814368275696879.zip
-rwxrwxrwx 1 root root  24M Aug  1 21:09 3.5.574.1.3.9030958.6.376.1780887819048872979.zip
-rwxrwxrwx 1 root root  12M Aug  1 21:09 3.5.574.1.3.9030958.6.376.2860280475000825621.zip
drwxrwxrwx 2 root root 4.0K Aug  2 17:33 x
-rwxrwxrwx 1 root root  12M Aug  1 21:09 x.zip
drwxrwxrwx 2 root root 4.0K Aug  2 17:33 y
-rwxrwxrwx 1 root root  12M Aug  1 21:09 y.zip

from dbx.zip_dcm_ds import ZipDCMDataSource
spark.dataSource.register(ZipDCMDataSource)

# read DCMs with `numPartitions` parallelism.
df = spark.read.format("zipdcm").option('numPartitions',4).load("./resources")
df.display()

rowid	path	meta
1	resources/dcms/1.3.199.1.2.3712432.1.402.1107814368275696879.zip::1-1.dcm	{'00080012': {'vr': 'DA', 'Value': ['20110212']}, '00080013': {'vr': 'TM', 'Value': ['172514']}, '00080014': {'vr': 'UI', 'Value': ['1.3.199.1.2.3712432.1.402.6877431522853594128']}, '00080016': {'vr': 'UI', 'Value': ['1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.22']}, '00080018': {'vr': 'UI', 'Value': ['1.3.199.1.2.3712432.1.402.1226077462190883904']}, '00080020': {'vr': 'DA', 'Value': ['20110212']}, '00080021': {'vr': 'DA', 'Value': ['20110212']}, '00080023': {'vr': 'DA', 'Value': ['20110212']}, '00080030': {'vr': 'TM', 'Value': ['172514']}, '00080031': {'vr': 'TM', 'Value': ['172517']}, '00080033': {'vr': 'TM', 'Value': ['172514']}, '00080050': {'vr': 'SH', 'Value': ['359B9601']}, '00080060': {'vr': 'CS', 'Value': ['SR']}, '00080070': {'vr': 'LO', 'Value': ['QIICR']}, '00080090': {'vr': 'PN', 'Value': [{'Alphabetic': 'MCCONNELL^TIFFANY'}]}, '00081030': {'vr': 'LO', 'Value': ['CT ANGIO CHEST (NON-CO']}, '0008103E': {'vr': 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